科研工作
首都医科大学附属北京康复医院150个粪便样本检测分析项目竞争性谈判公示
首都医科大学附属北京康复医院150个粪便样本16S V3-V4区Miseq PE300
测序分析及400个血清样本炎症因子检测分析项目竞争性谈判公示
首都医科大学附属北京康复医院院内课题拟采用竞争性谈判的方式选定合作单位,基本情况如下:
1、项目名称:首都医科大学附属北京康复医院100个样本16S rDNA测序分析,240个血清样本炎症因子检测分析项目
2、项目内容及范围:
(1)负责首都医科大学附属北京康复医院院内课题100个粪便微生物多样性测序及分析,每个样品产生的目标测序量为10,000 raw tags(实际每个样品产生的测序量不低于目标测序量的90%)。
(2)负责首都医科大学附属北京康复医院院内课题240个血清样本五个炎症因子的Elisa试剂盒检测分析。
3、受委托单位的资质及人员配置要求
(1)委托单位须有在中华人民共和国境内合法注册的独立法人。
(2)专业资质要求:具有相关项目检测资质,并且有相关成绩证明。
(4)竞标单位不得将本项目内容以任何方式进行转包。
(5)本次委托项目不接受联合体竟标报价。
(6)本项目对未选中的公司不做任何解释。
4、报价费用与项目:
分析内容 |
分析条款 |
备注 |
标准信息分析 |
1 测序数据质控
1.1下机数据质控
1.2根据Barcode拆分数据,获得不同样本数据
1.3去除Barcode和引物序列,对数据进行低质量过滤和拼接
1.4对拼接的Tags进行长度过滤、嵌合体去除等 |
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2 OTUs基础分析
2.1 OTUs聚类及代表序列选取
2.2 OTUs分布Venn图
2.3 Alpha多样性分析:Observed species,Chao1,Shannon,Simpson指数计算,物种累积曲线、等级丰度图绘制。
2.4 Beta多样性分析:UPGMA层次聚类分析(unweighted unifrac和weighted unifrac);PCA分析;Anosim分析(unweighted unifrac和weighted unifrac);PCoA分析;非度量多维尺度分析(NMDS)。 |
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3 物种分析
OTUs序列与数据库(RDP数据库、NT-16S数据库、Customized database)依次比对,得到各个样本所有OTU的物种注释;默认选取丰度最高的20个物种进行相对丰度计算,并以堆叠柱状图(stacked bar chart)、热图(Heatmap)形式展现;利用Krona软件对单样品物种注释结果及丰度进行动态可视化展示;通过某一分类水平下OTU序列碱基差异结合各个OTU序列的物种注释信息构建物种进化树。 |
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4 显著性差异分析 |
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五个炎症因子的Elisa试剂盒检测;检测指标:CRP TNF-
5、预计费用:62500元。
6、合同有效期:2年
7、受委托人应当承担其报价文件准备和递交所涉及的一切费用,不论谈判结果如何,委托单位对上述费用不负任何责任。
8、响应性文件份数:3份(正本1份、副本2份)
9、递交响应性文件截止时间:2019年1月25日(周五)下午16:00
递交地点:首都医科大学附属北京康复医院内分泌科
响应性文件接收人:彭彦平
10、计划谈判时间:2019年2月1日(周五)下午15:00
届时请参加谈判的单位法定代表人或法人委托人准时参与谈判。
11、公示起止日期:2019年1月18日-2018年1月25日
12、联系人:彭彦平
联系电话:010-56981455