招标采购
北京康复医院科研项目竞争性谈判公示
首都医科大学附属北京康复医院150个样本16S V3-V4区Miseq PE300
测序及分析项目竞争性谈判公示
首都医科大学附属北京康复医院院内课题脑卒中患者康复治疗前后肠道微生物和组织表观基因改变与MR表现的相关性分析项目组拟采用竞争性谈判的方式选定合作单位，基本情况如下：
1、项目名称：首都医科大学附属北京康复医院150个样本16S V3-V4区Miseq PE300测序及分析项目
2、项目内容及范围：
负责首都医科大学附属北京康复医院院内课题脑卒中患者康复治疗前后肠道微生物和组织表观基因改变与MR表现的相关性分析150个微生物多样性测序及分析，每个样品产生的目标测序量为20,000 raw tags（实际每个样品产生的测序量不低于目标测序量的90%）。
3、受委托单位的资质及人员配置要求
（1）委托单位须有在中华人民共和国境内合法注册的独立法人。
（2）专业资质要求：具有相关项目检测资质，并且有相关成绩证明。
（3）委托单位检验实验室必须在北京。
（4）竞标单位不得将本项目内容以任何方式进行转包。
（5）本次委托项目不接受联合体竟标报价。
（6）本项目对未选中的公司不做任何解释。
4、报价费用与项目：
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分析内容 |
分析条款 |
备注 |
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标准信息分析 |
1 测序数据质控
1.1下机数据质控
1.2根据Barcode拆分数据，获得不同样本数据
1.3去除Barcode和引物序列，对数据进行低质量过滤和拼接
1.4对拼接的Tags进行长度过滤、嵌合体去除等 |
默认全做 |
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2 OTUs基础分析
2.1 OTUs聚类及代表序列选取
2.2 OTUs分布Venn图
2.3 RankAbundance曲线
2.4稀释曲线（Rarefaction Curve)
2.5 Shannon-Wiener曲线
2.6 Specaccum物种累积曲线
2.7Alpha多样性指数计算
2.8 不同组间Alpha多样性盒型图 |
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3分类学分析
3.1 OTUs注释及各分类水平（界门纲目科属种）上物种在不同样品中分布情况统计
3.2 Core Microbiome分析
3.3各分类水平（门纲目科属）物种组成分析
3.4 OTUs序列注释结果交互式展示
3.5各分类水平（门纲目科属）物种聚类热图
3.6 物种进化关系及注释结果可视化展示
3.7 差异物种统计分析
两两组间物种差异显著性分析(Metastat分析)
多组间物种差异显著性分析（Kruskal-Wallis检验）
LefSE分析 |
编号3.7项分析要求至少两组处理，每组处理至少3个生物学重复 |
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4 样本比较分析
4.1 Beta多样性指数计算和样品间差异矩阵构建
4.2 系统进化关系展示
4.3 PCoA分析
4.4 多样本聚类树构建（Hclust）
4.5 PCA分析
4.6 NMDS分析
4.7 组间群落结构差异显著性分析（Anosim, Amova） |
2个样品以上提供此项分析；编号4.7项分析要求至少两组处理，每组处理至少3个生物学重复 |
5、预计费用：85,000.00元。
6、合同有效期：2年
7、受委托人应当承担其报价文件准备和递交所涉及的一切费用，不论谈判结果如何，委托单位对上述费用不负任何责任。
8、响应性文件份数：3份（正本1份、副本2份）
9、递交响应性文件截止时间：2018年8月24日下午16：00
递交地点：首都医科大学附属北京康复医院放射科
响应性文件接收人：李优伟
10、计划谈判时间：2018年8月28日下午15:00
届时请参加谈判的单位法定代表人或法人委托人准时参与谈判。
11、公示起止日期：2018年8月17日-2018年8月24日
12、联系人：李优伟
联系电话：010-56981189
京公网安备11010702002302号