科研工作
北京康复医院200个样本16S V3-V4区Miseq PE300测序及分析项目竞争性谈判公示
首都医科大学附属北京康复医院院内课题“植物内生菌与肠道菌群的关系“项目组拟采用竞争性谈判的方式选定合作单位,基本情况如下:
1、项目名称:首都医科大学附属北京康复医院200个样本16S V3-V4区Miseq PE300测序及分析项目
2、项目内容及范围:
负责首都医科大学附属北京康复医院院内课题“植物内生菌与肠道菌群的关系“200个微生物多样性测序及分析,每个样品产生的目标测序量为30,000 raw tags(实际每个样品产生的测序量不低于目标测序量的90%)。
3、受委托单位的资质及人员配置要求
(1)委托单位须有在中华人民共和国境内合法注册的独立法人。
(2)专业资质要求:具有相关项目检测资质,并且有相关成绩证明。
(3)委托单位检验实验室必须在北京。
(4)竞标单位不得将本项目内容以任何方式进行转包。
(5)本次委托项目不接受联合体竟标报价。
(6)本项目对未选中的公司不做任何解释。
4、报价费用与项目:
分析内容:标准信息分析
分析条款:
1数据质控及OTU基础分析: 1.1有效数据统计;1.2优质序列长度分布
1.3 OTU聚类分析;1.4 OTU分布Venn图;1.5 OTU分布花瓣图
2 Alpha多样性分析:2.1稀释性曲线;2.2 Shannon-Wiener曲线
2.3 Rank-Abundance曲线;2.4 Specaccum物种累积曲线
2.5 Alpha多样性指数
3物种注释:3.1 OTUs注释;3.2 Core microbiome分析;3.3物种组成分析;3.4属水平进化发生树;3.5样本聚类柱状图;3.6Krona物种展示;
3.7OTU及其分类学heatmap分析;3.8三元相图
4 Beta多样性分析:4.1基于unifrac的heatmap;4.2基于unifrac的PCoA分析;4.3 Hcluster分析;4.4 PCA分析;4.5 NMDS分析;4.6 PLS-DA分析;
5多元统计分析:5.1 Metastats分析;5.2 Kruskal-Wallis检验;5.3 Amova方差分析;5.4 Wilcoxon检验;5.5 Anosim分析;5.6 LefSe分析
高级分析 5 相关性分析:5.1 网络互作图;5.2环境因子关联分析
个性化分析 6 Picrust功能预测
5、预计费用:100,000.00元。
6、合同有效期:2年
7、受委托人应当承担其报价文件准备和递交所涉及的一切费用,不论谈判结果如何,委托单位对上述费用不负任何责任。
8、响应性文件份数:7份(正本1份、副本6份)
9、递交响应性文件截止时间:2020年6月19日下午17:00
递交地点:首都医科大学附属北京康复医院放射科
响应性文件接收人:李优伟
10、计划谈判时间:2020年6月23日下午15:00
届时请参加谈判的单位法定代表人或法人委托人准时参与谈判。
11、公示起止日期: 2020年6月9日-2020年6月16日
12、联系人:李优伟
联系电话:010-56981189